西南交通大学研究生专业有：岩土工程、结构工程、市政工程、防灾减灾工程、防护工程、桥梁与隧道工程、道路与铁道工程、建筑与土木工程、交通运输工程、生药学等。

岩土工程：是土木工程的分支，是运用工程地质学、土力学、岩石力学解决各类工程中关于岩石、土的工程技术问题的科学。

结构工程：是研究土木工程中具有共性的结构选型、力学分析、设计理论和建造技术和管理的学科。

市政工程：是培养熟悉市政工程结构理论，具有市政工程施工能力，掌握市政工程施工组织设计及市政工程造价编制方法，直接从事城镇给排水工程、污废水处理工程、道路与桥梁工程施工的高级应用性专门技术人才。

防灾减灾工程：专业定义防灾减灾科学与工程主要研究气象灾害产生的机理和自然规律、衍生灾害的探测、预警和减灾，培养能在极端天气预警、极端天气次生灾害处理、雷电科学与防护工程、空间天气灾害与预报等各相关领域从事勘察、设计、施工、管理等工作的应用型、复合型工程技术人才。例如：在地质、气象、交通、铁路、国家电网、石化、移动、矿产等相关部门、研究所等从事相关的防灾减灾的工作。

防护工程：指的是为抵抗杀伤武器破坏而构筑的各种工程建筑物。防护工程，按性质分为野战防护工程和永备防护工程；按结构形式分为露天式、掩盖式和坑道式防护工程。用于掩护人员的防护工程多为掩盖式和坑道式。大型的人员防护工程，除具有较高的抗力外，还有防核、防化学、防生物武器和防火、防潮功能及各种生活设备。坚固的楼房、厂房的地下室和矿井、隧道、地下铁道、天然洞穴等，战时均可改建成大型的防护工程。

桥梁与隧道工程：属土木工程的二级学科，是集设计、施工与工程管理为一体的具有很强实践性的工程学科，旨在培养与工程建设领域相关的各种高级技术与管理人才。

道路与铁道工程：道路与铁道工程是一级学科交通运输工程的二级学科，此学科是研究铁道、公路、城市道路和机场等交通基础设施的规划、勘测、设计、施工、运营、养护和管理中基础理论与关键技术的学科。

建筑与土木工程：是研究人类社会和生活所需要的基础设施建设的规划、设计、建造和维护的工程领域。其工程硕士学位授权单位培养从事区域规划，城市和村镇规划，城市设计，建筑与结构设计，市政工程设计，桥梁、道路与隧道工程设计，地下与水工结构设计及其勘测、施工、维护等高级工程技术人才。

交通运输工程：是一门综合性的技术学科，主要研究包括铁路、公路、水路及航空运输基础设施的布局及修建、载运工具运用工程、交通信息工程及控制、交通运输经营和管理、交通规划、交通设施设计等与交通相关的各个方面。

生药学：指以生药为主要研究对象，对生药的名称、来源（基源）、生产（栽培）、采制（采集、加工、炮制）、鉴定（真伪鉴别和品质评价）、化学成分、医疗用途、组织培养、资源开发与利用和新药创制等的学问。换句话说，生药学是利用本草学、植物学、动物学、化学、药理学、医学、分子生物学等知识研究天然药物应用的学科。